Четвёртому Райкагэ сообщают о похищении его брата, Киллер Би, членами Акацуки. Один из двух великих жаб-отшельников Фукасаку прибывает в Коноху с ужасной новостью о смерти Дзирайи. Фукасаку, на чьей спине Дзирайя оставил предсмертное послание, которое предстоит расшифровать, также сообщает о пленённом жителе Деревни Дождя, а также об убитом одном из тел Пэйна, чьё вскрытие предстоит провести. 

Наруто разгадывает цифровой шифр, оставленный Дзирайей — в виде номеров страниц последнего романа Саннина скрывалась фраза «В действительности настоящего среди них нет». Фукасаку забирает с собой Наруто в страну жаб Мёбоку, где начинает обучение того сэндзюцу — использованию природной чакры. 

Используя полученные сведения, группе расследования Конохи удаётся установить, что тела Пэйна управляются кем-то со стороны. Одно из тел Пэйна извлекает из Сидзунэ информацию о том, где находится Наруто, после чего убивает её. Тела Пэйна, узнав необходимое, покидают территорию деревни и устраивают мощнейший взрыв, разрушивший почти все постройки. На горе Мёбоку узнают, что посыльная жаба Косуки была убита, в то же время очутившаяся недалеко от Конохи Сима понимает, что на деревню напали, после чего призывает Фукасаку и Наруто с сильнейшими жабами клана Гама. 

Наруто побеждает еще одно тело Пэйна. Мир Бога убивает Фукасаку и приковывает Наруто к земле, после чего рассказывает о причинах почему хочет принести в этот мир боль — чтобы люди, испугавшись её, прекратили войны. Используя полученные ранее сведения, отец Ино догадывается, что ниндзя, руководящий телами Пэйна находится на самой высокой горе возле Конохи. 

Ценой своей жизни Нагато воскрешает всех убитых им в Конохе. Вместе с ними из мира мёртвых возвращаются Фукасаку, Сидзунэ, а также Какаси, встретивший во тьме своего отца и успевший сказать ему слова, которые давно хотел донести до него — о том, что он его понимает и прощает. Конан отрекается от Акацуки и сообщает Наруто, что будет помогать ему как лидер Деревни Дождя. В Конохе Наруто приветствуют как героя.  

152 Мрачные новости

153 Следуя за тенью учителя

154-155 Расшифровка/Первый вызов

156 Превосходить учителя

157 Коноха атакована!

158 Сила веры

159 Пэйн против Какаши

160 Тайна Пэйна

161 Я — Конохамару, из рода Сарутоби

162 Миру — боль

163 Взрыв! Режим Отшельника!

164 На пределе! Режима Отшельника больше нет!

165 Захват Девятихвостого завершён

166 Признание

167 Чибаку Тэнсэй

168 Четвёртый Хокаге

169 Два ученика

170-171 Большое приключение! В поисках наследства Четвёртого Хокаге!

172 Встреча

173 Рождение Пэйна

174 Сказание об Узумаки Наруто

175 Герой Скрытого Листа